Charlotte Amalie leží na ostrově sv. Tomáše, který je součástí Amerických Panenských ostrovů, autonomního ostrovního území USA. Zároveň je jejich největším a hlavním městem. V minulosti byl přístav rájem pirátů, v dnešní době je rájem turistů. Město založil kolem roku 1666 Jørgen Iversen, který ho pojmenoval na počest královny Šarloty Amálie (1650-1714), manželky dánského krále Kristiána V. Místo však bylo osídleno již dávno před tím, než na něj vstoupil první Evropan. Když se v roce 1493 na ostrově vylodil Kryštof Kolumbus, žily zde již dávno domorodé kmeny. Židé, prchající před španělskou a portugalskou náboženskou nesnášenlivostí přišli do Karibiku poprvé kolem roku 1654. Pouhých devět rodin zde již v roce 1796 vystavělo první synagogu. Dnešní synagoga byla vystavěna v roce 1833 a je nejstarší synagogou v nepřetržitém provozu pod americkou vlajkou. Město je známé pro svou dánskou koloniální architekturu, na kterou zde můžeme hojně narazit. Za návštěvu také stojí Frederick Lutheran Church. Historie města je spjata s mnohými pirátskými historkami. Najdeme zde jak Blackbeard's Castle, který postavili Dánové v 17. století, tak i Bluebeard's Castle, jehož stavba je připisována pirátům. Fort Christian, kterou nechal postavit dánský král Kristián V. v roce 1671 je nejstarší stojící stavba na celém soustroví Panenských ostrovů. V Emancipačním parku pak můžou návštěvníci obdivovat nejen kopii Zvonu svobody. Tyrkysové moře, záplavy rozkvetlých bougainvilleí na skalnatých mořských útesech, to vše spolu s bohatou historií přiláká ročně mnoho turistů toužících po odpočinku v tomto tropickém ráji.
Ostrov, jež je bývalou dánskou kolonií, zakoupily Spojené státy spolu se sousedními ostrovy St. John a St. Croix v roce 1917 za 25 mil. dolarů ve zlatě.